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北京百奥知信息科技有限公司专业、专注,提供生物医药整体信息解决方案。对整个基于Web的行业应用软件的开发提出了一整套轻量级的、独创性的程序框架体系BioKnow UAP平台......

 
 
           解决方案

针对不同领域的功能需求, Bioknow提供整体解决方案,包括临床研究,实验室,精准医学,生物信息等领域。

      生物信息平台解决方案
序列数据管理与分析系统 Seq
生物数据分析系统 DataAnalysis
分子网络注释系统 MolNet

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生物信息化解决方案

研发背景:

生物信息学作为一个交叉学科,其衍生的学科包括结构基因组学,功能基因组学,比较基因组学,蛋白质学,药物基因组学,中药基因组学,肿瘤基因组学,分子流行病学和环境基因组学,微生物基因组学,植物基因组学;同时生物信息学作为一个有力的研究工具与手段,在生物、医学、药学、农学中的应用也越来越广泛,并逐渐得到学者们的重视。

解决方案:

百奥知针对当前现状研发生物信息平台:

1)序列数据管理与分析集成平台,为实验室提供基于序列产生和管理以及后续处理的一体化平台。构建本地序列库管理平台,对实验室产生的序列导入导出,构建数据质控审核机制;构建本地Blast比对数据库,对数据进行比对检索、高度同源检索、进化树构建等;对病毒微生物序列进行序列突变位点分析和耐药分析,对具有参考序列数据自动鉴别突变位点,并进行深入分析如耐药位点变异分析、序列基因型血清型、表面抗原分析等生物信息相关层次自动分析注释需求;集成Windows、Linux平台算法,构建基于Web界面的算法配置。具有强大的数据查询、导航、视图分析、汇总功能。支持功能扩展和结构化定制,能够满足序列信息收集与科研中的个性化需求,为序列研究中的序列信息收集、序列分析等提供强有力的信息化保障。该方案具有统一的技术规范和标准,能够实现信息资源的共享,具有很好的实际应用价值,提供强有力的信息化保障。

2)生物数据分析系统主要包括:1 高通量数据分析,显著性分析、聚类分析、相关分析、主成分分析;2 SNP分析,Hardy-Weinberg平衡、LD分析、单体型分析;3 医学统计分析,假设检验、方差分析、分参数检验、生存分析、回归分析等。分析流程化:芯片分析,数据质控->显著性分析->聚类分析->相关分析->主成分分析;SNP分析,基因型频率的计算->Hardy-Weinberg平衡->连锁不平衡分析->单体型分析。算法的集成:高通量数据处理算法集成,常用医学统计算法的集成。

3)生物分子网络注释系统(Molecule Network Annotation System,MolNet)是一个对高通量生物实验数据提供全面生物学功能注释的分析平台系统。系统可处理多个物种的高通量实验数据,如测序数据、各种探针数据等,具有全面、快速、准确、直观等特点。将目前多种生物信息学公共数据库中的注释相关信息相整合,集成了Genbank、SwissProt等通用序列数据库,以及Gene Ontology、KEGG、BioCarta、mirBase、EPD、HPRD、 MIND、OMIM等功能数据库,提供包括基因、蛋白、功能、表达、蛋白相互作用、调控等生物学信息,有助于用户了解表达基因之间的相互关系。提供包括基因、蛋白、功能、表达、蛋白相互作用、调控等生物学信息,有助于用户了解表达基因之间的相互关系。

 

 
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